一、化学结构与特性
1.分子组成
化学名称：9-O-二甲基三苯甲基-三乙二醇-1-(2-氰乙基)-(N,N-二异丙基)-磷酰胺酯（9-O-Dimethoxytrityl-triethylene glycol,1-[(2-cyanoethyl)-(N,N-diisopropyl)]-phosphoramidite）。
分子式：C₃₆H₄₉N₂O₇P，分子量652.76。
结构特征：由三乙二醇链（9个原子，含6个碳和3个氧）构成，末端连接二甲基三苯甲基（DMT）保护基和2-氰乙基-(N,N-二异丙基)磷酰胺酯活性基团。
2.物理性质
货号：Y-R-4540
外观性状：固体
规格：5mg，10mg，25mg
二、合成应用
1.寡核苷酸修饰
作用：作为间隔臂（Spacer Arm）引入寡核苷酸链，通过三乙二醇链提供灵活的空间分隔，优化分子构象。
修饰位点：可添加于寡核苷酸的5'-端、3'-端或内部任意位置。
多重插入：支持连续添加多个Spacer 9单元，构建更长的间隔臂。
2.典型应用场景
发夹环结构：在寡核苷酸发夹环中形成非核苷酸桥，稳定二级结构。
药物开发：连接寡核苷酸与表位（Epitope），构建抗体-寡核苷酸偶联物（AOC）。
固相杂交探针：通过间隔臂实现探针在固相载体（如微球、芯片）上的定向固定，提升杂交效率。
三、使用注意事项
1.溶解与储存
建议使用无水溶剂（如乙腈）溶解，避免水分导致磷酰胺酯水解。
长期储存需-20°C以下冷冻，避免反复冻融。
2.合成条件优化
耦合时间：通常为5-10分钟，需通过涡旋确保完全溶解后再上机合成。
脱保护与切割：需严格遵循供应商提供的脱保护试剂（如氨水、甲胺）和温度条件，避免侧链断裂。
3.质量控制
纯度检测：通过HPLC（高效液相色谱）验证，纯度应≥95%。
结构确认：可通过质谱（MS）或核磁共振（NMR）确认分子量及结构完整性。
四、有关试剂
C6 Spacer Amidite (DMT-1,6-Hexandiol)
BHQ-3 DMT Amidite
5-Nitroindole Amidite
TET Amidite, Single Isomer (N-TET-6-Aminohexanol)
BHQ-2 Amidite
CAL Fluor Orange 560 Amidite
5'-Phosphorylating Amidite II (O-DMT-2,2-di(ethoxycarbonyl)propan-1,3-diol)
5'-MMT-Amino C6 Modifier (MMT-6-Aminohexyl Amidite)
Lysine-dextran
Dextran Gel
Dextran Methacryloyl (DexMA)
n-Dodecyl-beta-D-maltoside
UDP-6-N3-Galactose
UDP-b-L-arabinopyranose disodium salt
FMOC-L-SER(BETA-D-GLCAC4)-OH
以上由陕西新研博美生物科技WWH编辑提供的试剂信息仅用于科学研究等。
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